寶德推出科學計算HPC解決方案 |
發布時間: 2012/8/15 14:58:03 |
大部分科學計算對處理器的浮點運算能力和內存性能要求很高,都屬于計算密集型和訪存密集型應用。如對于典型的物理和化學計算,計算節點一般選用雙路及以上服務器,每個計算節點提供8-24處理器核心,平均每個核心可以配置2-4GB內存。對于一些大型共享式內存并行程序,則推薦采用計算核心更多的SMP胖節點以便獲得最佳性能加速比。
寶德針對國內科研院所的科學計算需求,推出了針對物理和化學計算的HPC解決方案。寶德技術專家分析,大部分物理化學軟件都是MPI并行程序,并行加速比較好,通常可以擴展到32~128進程以上,程序運行方式通常是跨節點并行運行;從并行算法分析,計算材料軟件的進程間通信比較頻繁,屬于通信密集型應用。因此,節點間網絡的延遲和帶寬對程序的并行加速比起著決定性的作用。使用傳統的千兆以太網很難發揮程序的并行性能,跨節點運行時會導致嚴重的性能下降,成為整個計算過程的瓶頸。這樣推薦用戶使用高帶寬、低延遲的InfiniBand網絡。 寶德典型的物理化學計算集群系統包括登錄節點,計算節點,存儲節點和交換系統,并且具有優異的性能和良好的擴展性。計算節點選用寶德高密度服務器平臺,1U雙路多節點服務器PR1720H,滿足一般計算軟件和計算任務的需求;計算系統還可以根據需要配置幾臺四路或八路SMP胖節點,專為Gaussian等OpenMP并行程序或其它一些大內存應用配備。集群系統配置了兩臺寶德PR2510V服務器作為管理登錄節點,兩臺登錄管理節點配置雙機熱備,對作業調度、用戶管理等系統服務實現雙保險,提高整個集群的高可用性。 計算網絡采用高帶寬、低延遲的QDR InfiniBand網絡,為并行程序提供無阻塞的通信高速通道;另外,配置一套或兩套千兆網絡,用于集群管理和監控,千兆網絡也可作為備用計算網絡,提高系統的高可用性;存儲系統采用寶德GS-5120 FC/iSCSI-SAN磁盤陣列,提供了海量數據存儲能力的同時,其創新的RAID 級別提供了更高的數據保護功能。強大的硬件設計,靈活的擴展操作和友好的管理界面,為客戶不同應用提供簡單方便的解決方案。 本方案選擇了業界領先的寶德PR7010B刀片服務器,采用最新的處理器架構,計算網絡使用40Gb的QDR Infiniband,非常適合計算物理、計算化學這樣的計算密集型和通信密集 型應用;大容量、高性能、高容錯、高可擴展性的分布式并行存儲系統為集群提供了強大的存儲支持。冗余電源,熱插拔硬盤,高可靠的服務器存儲系統等設備和技術保證系統的可靠穩定運行;雙登錄管理節點、備用計算網絡、存儲系統的高容錯技術為集群的提供了更高的可靠性。 寶德物理化學計算HPC解決方案不僅保障現有條件下的高性能計算,并且綠色節能,實現彈性部署。系統設計為用戶預留了自由的可擴展空間,用戶可根據業務系統的增長,靈活地增配計算節點,擴充計算網絡,提升計算性能;擴充存儲系統的容量和性能,滿足增長的數據存放和IO性能需求。另外集群還引入寶德PDCM智能功耗控制系統能夠根據集群負載實時調整整個系統功耗,在不影響集群性能的情況下實現20%節能,真正實現綠色高效能計算。 本文出自:億恩科技【www.vbseamall.com】 |